Учебная деятельность осуществляется на основе Федерального закона от 29 декабря 2012г. № 273-ФЗ «Об образовании в Российской Федерации», Федерального государственного образовательного стандарта образования обучающихся с умственной отсталостью (интеллектуальными нарушениями) (приказ от 19.12.2014 г. №1599), адаптированной основной общеобразовательной программе образования обучающихся с умственной отсталостью (интеллектуальными нарушениями) КГБОУ «Кокщинская общеобразовательная школа-интернат"» и направлена на реализацию целей и задач специального образования, ориентирована на максимальную индивидуализацию и дифференциацию обучения. Особое внимание уделяется организации дополнительного образования детей, их досуга.
Вся система работы школы-интерната нацелена на создание условий для непрерывного обучения, воспитания, коррекции и охраны здоровья обучающихся. Комплексное психолого-педагогическое сопровождение обучающихся школы-интерната осуществляется педагогами, педагогами–психологами, учителем-дефектологом, учителями–логопедами, социальным педагогом в течение всего срока обучения.
В учреждении создана модель непрерывной психолого-педагогической помощи детям с ограниченными возможностями здоровья по развитию психических процессов, креативных способностей, мелкой моторики, коррекции речевых нарушений.
В школе-интернате организована работа ППк. Школьный психолого-педагогический консилиум разрабатывает и утверждает программы сопровождения обучающихся, определяет индивидуальный образовательный маршрут.
В образовательном учреждении организован консультативный прием обучающихся и их родителей (законных представителей), педагогов дошкольных образовательных учреждений, учителей общеобразовательных школ узкими специалистами.
Государственная аккредитация образовательной деятельности по адаптированным основным общеобразовательным программам для обучающихся с умственной отсталостью не предполагается.
В КГБОУ «Кокшинская общеобразовательная школа-интернат» образовательная деятельность осуществляется по следующим образовательным программам: